2018年6月6日 · 一般而言，我们环境微生物组学常用的，也是认可度比较高的测序区域是v3-v4，v4-v5，或者单测v4区。 那不同的测序区域对于我们的数据结果有什么影响呢？

2024年7月24日 · Seurat V5和 V4 同时安装，以及互相转换. 既有之前分析的V4版本seurat对象又想要V5版本的功能等等，需要V4 V5同时使用的情况下，如何正确安装以及使用呢： 一：已 …

2024年7月24日 · 在 Seurat v5 整合工作流程中，相比起 v4，开发团队引入了 Layer 数据结构， 并且工作流程从代码/可用性角度进行了简化，但 v5总体步骤与v4工作流程相同。

不过从官网的介绍看起来，两个版本的变化也不是特别大，而且 V4中的seurat函数和工作流继续在v5中工作. 目前seurat包已经是更新到5.0.1的版本了，官网上对更新的内容和基本分析流程也 …

2024年11月7日 · 我们额外选取了两个10x小鼠脑单细胞转录组数据集，来测试V4与V5在数据整合上的差异。 V4使用IntegrateData函数进行多样本的整合，整合前单样本的数据需要完成标准...

v4-v6（长度：540bp+）适用于454平台或ion s5系列测序平台，结果与16s rrna基因全长结果接近。 （yang b, et al. 2016） 注意： 1. ion s5系列测序平台，目前可以测长片段，因此本人仅仅 …

2024年6月23日 · 本文介绍了如何在Seuratv5中处理由v4创建的文件，重点讲解了两者之间的对象转换、数据结构变化、整合流程、差异表达分析和SCTransform更新。 虽然官网未提供直接 …

2021年2月16日 · Each primer set revealed higher internal diversity within certain bacterial taxonomic groups (e.g., the class Bacteroidia by V3-V4, and the phylum Planctomycetes by …

叶绿体/线粒体潜在污染较为严重的样本可考虑v5-v7区引物。 V3-V4和V4-V5适用性比较广。 若关注双歧杆菌时，可优先考虑V3-V4，关注海洋细菌SAR111时可优先考虑V4-V5。

2025年3月11日 · These are the previous versions of the repository in which changes were made to the R Markdown (analysis/seurat_v4_vs_v5.Rmd) and HTML (docs/seurat_v4_vs_v5.html) …