2022年5月11日 · 支持WDL自定义函数的引用。 执行顺序：按上一步output——>下一步input. 若上一步task1没有输出，如何保证task2等顺序？ 需要在task1中定义一个output，再在后面task定义为input。 4. 运行参数 runtime. 记录运行中使用的资源信息，包括docker、CPU、GPU、memory等 …

2022年5月11日 · 支持WDL自定义函数的引用。 执行顺序：按上一步output——>下一步input. 若上一步task1没有输出，如何保证task2等顺序？ 需要在task1中定义一个output，再在后面task定义为input。 4. 运行参数 runtime. 记录运行中使用的资源信息，包括docker、CPU、GPU、memory等 …

The Workflow Description Language (WDL) (pronounced as /hwɪdl/ or "whittle" with a 'd') is an open standard for describing data processing workflows using a human-readable/writeable syntax.

2023年12月13日 · The Webex Document Loader is an essential tool for document sharing and remote printing in the Webex environment. This guide will walk you through manually installing or uninstalling of the WDL zip file.

Webex Document Loader是Webex环境中文档共享和远程打印的重要工具。 本指南将指导您手动安装或卸载WDL zip文件。

2019年12月16日 · WDL是由 Broad Institute 开发的一种流程开发语言，全称 workflow description language。 使用Sublime Txet就可以，安装WDL插件就可以漂亮地显示WDL代码了。 这是一个我老板用来跑RRBS的pipeline，以此来学习。 String file_basename. String masterFolder. File Fastq_R1. File? Fastq_R2. Boolean paired. Boolean MspI. Int clip_R1. Int? clip_R2. Int three_prime_clip_R1. Int? three_prime_clip_R2. String genome_folder.

@contextlib. contextmanager def unpack (archive_fn: str)-> Iterator [UnpackedZip]: """ Open a context with the WDL source archive unpacked into a temp directory, yielding `UnpackedZip`. The temp directory will be deleted on context exit.

2021年11月28日 · WDL是由Broad Institute开发的一种生物信息流程开发语言，与传统的shell流程相比，具有复用性好、支持多种集群 架构 、便于多任务 并行 等优势，初次接触，写了个简易流程试水。 WDL语言的一些基本概念可参考以下教程： #工作流：先创建新目录，再创建一个空文件，最后在空文件中写入内容。

2024年4月1日 · WDL 标准允许不同的提供商支持不同的运行时属性来为用户提供更高级的功能。 Achelous 支持所有标准的Runtime 属性： Achelous 支持下述非标准的Runtime 属性，方便用户运行任务。 {"key1":"value1","key2":"value2",…} 指定执行任务的服务器节点的限制属性，常用于选定特定的计算节点来执行任务。 {"/a/dir1":"/mnt/dir1",…} 如果Task 失败，重投任务的时候，将CPU 的资源需求设置为：上次CPU 资源 x (1 + cputuneratio)。 如果Task 失败，重投任务的时候， …

2024年12月15日 · 项目简介: WDL（Workflow Description Language）是一个用于描述数据处理工作流程的开源标准，它具有易于阅读和编写的语法。 WDL使得定义分析任务、连接它们形成工作流程以及并行执行变得简单。 该语言旨在让各种用户（包括程序员、分析员和生产系统的操作员）都能轻松使用。 WDL支持常见的模式，如散射-聚集（scatter-gather）和条件执行，并能简单地表达这些模式。 WDL设计为可移植性，有多种运行在不同环境（包括高性能计算系统和云平 …