近日,重医附属儿童医院邱翔教授作为唯一通讯作者,在国际知名学术期刊《Nature Communications》上发表题为《Interplay between CTCF-binding and CTCF-lacking regulatory ...
▎药明康德内容团队编辑(来源:上海交通大学)在真核细胞中,大约两米长的基因组DNA被巧妙地分层包装,形成了从染色体区室到拓扑相关结构域再到染色质环的多层次高阶染色质结构,以适应微小的细胞核。CTCF(CCCTC结合因子)与粘连蛋白通过“环挤出”的方式 ...
本文构建框架识别并优先排序 CTCF 结合位点(CBS)变异,为研究非编码变异提供思路。 一、引言 CCCTC 结合因子(CTCF)通过在数千个基因组位点结合其 DNA 序列基序发挥作用,这些 CTCF 结合位点(CBSs)能够通过调节基因组的三维(3D)组织来促进或抑制基因表达。
研究人员为探究基因逃脱 X 染色体失活(XCI)的机制,研究 CTCF 及染色质环境的作用,发现二者可调控 Car5b 逃脱 XCI。 在哺乳动物的世界里,雌性细胞中的两条 X 染色体,其中一条会在发育过程中沉默,这就是神秘的 X 染色体失活(XCI)现象。它就像一把精准的 ...
研究发现,这些区域的突变与 12 种不同的癌症类型有关。这些突变发生在CTCF蛋白的结合位点上,而这些位点对于维持基因组的三维结构至关重要。
Mammalian genomes are organized by multi-level folding, yet how this organization contributes to cell type-specific transcription remain unclear. We uncovered that the nuclear protein SATB1 ...
These discoveries could have important medical implications, including diagnostic tests for causes of infertility linked to genome folding.